吉泽明步电影 北京畜牧兽医相干所猪遗传育种鼎新团队淡薄最优的低遮蔽全基因组测序填充战略|位点|性状
中枢指示：近日吉泽明步电影，中国农业科学院北京畜牧兽医相干所猪遗传育种科技鼎新团队淡薄了低遮蔽全基因组测序数据的最优的填充战略，并评估了填充后的全基因组测序数据的大白猪的养殖性状基因组展望准确性，为猪全基因组选拔和复杂性状的遗传机制明白提供了关键参考。相关相干实现发表在《动物杂志（Animal）》上。……（天下食物网-www.shijieshipin.com）
高跟玉足近日，中国农业科学院北京畜牧兽医相干所猪遗传育种科技鼎新团队淡薄了低遮蔽全基因组测序数据的最优的填充战略，并评估了填充后的全基因组测序数据的大白猪的养殖性状基因组展望准确性，为猪全基因组选拔和复杂性状的遗传机制明白提供了关键参考。相关相干实现发表在《动物杂志（Animal）》上。
团队首席王立贤相干员先容吉泽明步电影，低遮蔽全基因组测序时代不仅能克服高遮蔽全基因组测序高额用度，还能幸免SNP芯片中位点信息偏倚问题，是一种获取全基因组变异经济有用的神志。但低测序深度的基因分型具有随即性和不笃定性，为基因型准确填充加多了难度。本相干以具有低遮蔽全基因组测序数据的1423头大白猪群体为相干对象，并登科该群体中遗传孝顺最多的要津先人个体进行高遮蔽全基因组测序动作参考面板和混杂填充的战略进行基因型填充，比较不同战略下的填充准确性，然后评估填充后的全基因组序列数据全基因组展望的效果和比较全基因组关联分析实现。
相干发现，以要津先人个体的高遮蔽全基因组测序数据动作参考面板来填充低遮蔽测序数据是一种最优的战略，不错获取最高的填充准确性，同期发现罗致最优战略获取的全基因组数据比较于芯片数据对大白猪养殖性状基因组展望的准确性升迁了0.31～1.04%，同期还能升迁全基因组关联分析的统计效用。相干还武断到影响猪养殖性状相关的遗传位点偏激相关候选基因，其中基因EPC2、MBD5、ORC4和ACVR2A与总产仔数相关；IKBKE与产健仔数性状相关；HSPA13和CPA1与出身窝重相关；GTF2H5、ITGAV、NFE2L2、CALCRL、ITGA4、STAT1、HOXD10、MSTN、COL5A2和STAT4与妊娠天数相关。除了EPC2、ORC4、ACVR2A和MSTN外，其他皆是本相干新发现的候选基因。上述相干实现为低遮蔽测序数据在猪的基因组选拔息争析猪养殖性状遗传机理提供了参考，同期也为猪养殖性状芯片制定提供了权贵性位点。
博士相干生王晓庆和王立刚相干员为论文共同第一作家，赵福平相干员为通信作家。该相干得到了当然科学基金和农业科技鼎新经营等技俩标撑握。
原文连络：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1751731124001897
日历：2024-09-18吉泽明步电影
